Stress & Granules: regulation of Cauliflower mosaic virus disease in Arabidopsis thaliana

Virus är nära knutna till organismer de infekterar, starkt beroende av att vara kompatibla med flera av värdcellens komponenter och av att kunna underminera dessa. Under en virusinfektion översvämmas värdcellen med främmande nukleinsyror och cellen har lärt sig att känna igen, avväpna eller eliminera dessa. I sin tur har virus anpassat sig till att använda cellens RNA-reglerande maskineri till sin egen fördel. Cytoplasmatiska RNA-granuler, så kallade Processing bodies (PBs) och Stress-granules (SGs), ingår i cellens initiala RNA-reglering eftersom de innehåller och lagrar oöversatt RNA och anpassar sig i antal, storlek och sammansättning för olika påfrestningar, som exempelvis en virusinfektion. I denna avhandling har vi utforskat Arabidopsis thaliana RNA-granuler roll under en infektion av pararetroviruset Blomkålsmosaikvirus (CaMV). Vi visar att cellens PBkomponenter hjälper viruset att ackumuleras genom att skydda det virala RNA från cellens antivirala RNA-tystnadsmaskineri (Paper I). Dessutom visar vi att den cytoplasmatiska virala replikationsfabriken innehåller flera RNA-granulatproteiner under en infektion, inklusive PB-komponenter och SG-komponenter. I motsats till PBs är SGs troligen antivirala och CaMV undergräver deras biogenes genom sitt multifunktionella protein P6 (Paper II). I ett försök att hitta nya faktorer som påverkar risken för sjukdom utforskar vi variationen av CaMV-sjukdom i naturligt förekommande populationer av Arabidopsis thaliana. Vi påvisar också vikten av växthormonet abscisinsyra (ABA) och dess homeostas för CaMV-infektion, och hittar en ny CaMV-mottaglighetsfaktor, ABA-syntesgen NCED9 (Paper III).